工业循环冷却水、同城中央空调冷却塔等开放式循环系统中，原有的多种活体微生物，在适宜环境下不断繁殖生长，形成藻类、同城粘泥，以至于产生管道堵塞、同城降低热效率、同城引起腐蚀及卫生等多方面问题。藻类的产生降低了设备的工作效率，减少了设备的使用寿命，使经济效益下降。灭藻剂适用于循环冷却水系统，油田注水系统，冷冻水系统中，作为非氧化性杀菌灭藻剂，粘泥剥离剂使用，也可用作晴纶纤维染色的均染剂及其纺织加工前的柔滑和抗静电处理。

杀菌灭藻剂在饮用水处理中发挥着至关重要的作用。在自来水生产过程中，原水往往含有各种细菌、附近病毒和寄生虫等微生物，这些微生物会对人体的胃肠道造成损害，引起腹泻等症状。杀菌灭藻剂能够有效杀灭这些微生物，保证自来水的生物性。同时，它还能去除水中的藻类和其他浮游生物，防止水体的富营养化，从而保持饮用水的清澈和透明。 在工业用水领域，杀菌灭藻剂同样发挥着重要作用。工业生产过程中，往往需要大量的水作为冷却剂、附近洗涤剂等，这些工业用水的水质要求非常高。如果水中存在细菌、附近藻类等微生物，不仅会对设备造成腐蚀和堵塞，还会影响产品的质量和产量。杀菌灭藻剂的应用能够有效控制水中微生物的生长和繁殖，保证工业用水的稳定性和可靠性。