许多污水中的有机污染物成分复杂，部分有机物质难以被微生物直接利用。添加合适的碳源能够优化污水中有机物的组成结构，使得污水更易于被微生物进行生物降解，即提高污水的可生化性。可生化性提高后，细菌、附近真菌等微生物更易将污水中的有机污染物代谢分解为无害或低害的物质，如简单的无机化合物和二氧化碳，从而降低污水中的化学需氧量（COD）、生化需氧量（BOD）等污染指标，更好地达到污水排放的标准要求。?在生物除磷工艺中，碳源也至关重要。在厌氧和好氧交替的环境下，聚磷菌在厌氧阶段释磷时需要利用碳源合成细胞内的储能物质；在好氧阶段，聚磷菌又利用储存的能量超量摄取磷。如果碳源不足，聚磷菌无法正常进行这样的代谢过程，会导致除磷效果大打折扣。而适当地添加碳源能够保障聚磷菌的正常代谢，从而增强生物除磷的效果。

当污水中投加了新的碳源时，微生物为了有效分解利用这些碳源，会逐渐诱导产生新的酶系。例如，当向污水中加入一种复杂的碳源化合物，微生物可能产生特定的水解酶来分解该复杂物质。这种诱导产生新酶系的能力有助于微生物适应新的污水环境和污染物类型，随着时间的推移，微生物群落会朝着更有利于分解特定污水污染物的方向进化。如果污水中碳源长期匮乏或者种类单一，会导致微生物生长过程中竞争过度，一些处在竞争劣势的微生物逐渐消失， 微生物群落变得单一。单一的微生物群落容易走向退化，它们的污染物处理能力也相对较弱，而且会加大对环境变化的敏感性。多样化的碳源输入则可以避免这种情况的发生，维持微生物群落丰富的多样性，提高整个污水处理体系的稳定性和抗冲击能力。随着社会发展和工业布局调整，污水中的污染物质类型和含量可能发生变化。持续的碳源供应和多样的碳源成分可以使微生物群落能够更加灵活地应对这些变化。微生物通过调节自身代谢途径和酶系统，可以较快地调整适应新的污染物环境，保持污水处理的有效性。